Theo Hội đồng xét xử phúc thẩm, quá trình xét xử cho thấy các bị cáo đã nhận thức được hành vi của mình nhưng vẫn thực hiện với lỗi cố ý, do đó cần xử phạt để răn đe. Tuy nhiên, khi xem xét, tòa phúc thẩm xác định các bị cáo không có tình tiết tăng nặng. Về nguyên nhân, động cơ và mục đích phạm tội, tòa phúc thẩm xác định các bị cáo là lãnh đạo chủ chốt của VICEM, mong muốn xây dựng trụ sở khang trang và không có mục đích vụ lợi hay tư lợi cá nhân.
Trong quá trình triển khai dự án, các bị cáo đã không chấp hành pháp luật về đấu thầu và xây dựng, đây là nguyên nhân chính dẫn đến hệ lụy dự án dở dang và không được đưa vào khai thác. Tòa án nghiêm trị các bị cáo là người đứng đầu, nhưng cũng phân hóa các bị cáo theo vị trí, vai trò, tình trạng khắc phục hậu quả, xác định lỗi, mục đích và chính sách khoan hồng của pháp luật.
Xét kháng cáo của các bị cáo, Hội đồng xét xử phúc thẩm nhận thấy các bị cáo đều ăn năn hối cải và nhận thức được hành vi sai trái của mình. Sau phiên sơ thẩm cách đây 5 tháng, 9 bị cáo và những người liên quan đã kháng cáo xin giảm án và xem xét lại phần nghĩa vụ bồi thường 380 tỷ đồng. Trước và trong phiên phúc thẩm, các bị cáo đã được người nhà nộp thêm 119 tỷ đồng để khắc phục hậu quả. Các bị cáo cũng xuất trình thêm tài liệu chứng minh có nhiều thành tích trong công tác, bao gồm nhiều bằng khen và giấy khen.
Do đó, Hội đồng xét xử phúc thẩm quyết định chấp nhận giảm án cho các bị cáo. Cụ thể như sau:
Nhóm tội 'Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí' và 'Vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng'
- Bị cáo Nguyễn Ngọc Anh (cựu Tổng Giám đốc VICEM, án sơ thẩm 15 năm tù): 13 năm tù, phải nộp khắc phục 61 tỷ đồng.
- Bị cáo Dư Ngọc Long (cựu Giám đốc Ban Quản lý Dự án VICEM, án sơ thẩm 12 năm 6 tháng tù): 9 năm tù.
- Bị cáo Hoàng Ngọc Hiếu (cựu Trưởng phòng Thẩm định dự án VICEM, án sơ thẩm 11 năm tù): 10 năm tù.
Nhóm tội 'Vi phạm quy định về quản lý, sử dụng tài sản Nhà nước gây thất thoát, lãng phí'
- Bị cáo Lê Văn Chung (cựu Chủ tịch Hội đồng thành viên VICEM, án sơ thẩm 13 năm tù): 10 năm tù, phải nộp khắc phục 22 tỷ đồng, còn phải nộp 48 tỷ đồng.
- Bị cáo Tạ Quang Bửu (cựu thành viên Hội đồng thành viên kiêm Phó Tổng Giám đốc VICEM, án sơ thẩm 9 năm tù): 7 năm tù.
- Bị cáo Trần Bình Trọng và Nguyễn Lâm Cường (cùng là cựu Phó Tổng Giám đốc VNCC, án sơ thẩm 4 năm tù): 3 năm tù cho hưởng án treo, đã chấp hành xong hình phạt.
- Bị cáo Trịnh Công Loan (cựu thành viên Hội đồng thành viên VICEM, án sơ thẩm 4 năm tù): 3 năm tù nhưng cho hưởng án treo.
- Bị cáo Đoàn Thị Mai Lan (cựu Chủ nhiệm Bộ môn Kinh tế dự toán của VNCC, án sơ thẩm 3 năm tù): 3 năm tù nhưng cho hưởng án treo.
